确定分子式的方法有两种--同位素峰强比法和精密质量法
　　1. 同位素峰强比法　低分辨质谱采用这种方法确定分子量
　　1.1　计算法
　　这里仅介绍只含C、H、O的化合物，由于这类化合物的M+1同位素峰主要是C的贡献，根据公式：
　　，P为M+1峰的相对强度；P为M峰的相对强度
　　
　　
　　可以推算分子中含碳、氢和氧原子的数目。
　　1.2　查表法　根据同位素的峰强度比，可查Beynon表得到分子式。
　　2. 精密质量法　高分辨质谱可用该法确定分子式。
　　不同分子式所对应的精密分子量是不同的。根据所测得的精密分子量，查Beynon精密质量表或通过计算机检索，可直接得到分子式。